Tòa nhà được xây dựng vào năm 1914 với mục đích sử dụng như một tòa án dân sự dưới thời kỳ Nhật Bản cai trị Đài Loan. Sau khi hoàn thành, tòa án dân sự thuộc quyền quản lý trực tiếp của chính phủ toàn quyền Đài Loan. Năm 1945, người Nhật thất thủ và rút khỏi Đài Loan, tòa nhà được bàn giao lại cho Trung Hoa Dân Quốc và chính thức được công nhận là di tích lịch sử quốc gia hang 2 từ năm 1991. Tòa nhà được sử dụng như tòa án cho đến năm 2001 chính quyền thành phố Đài Nam quyết định di dời tòa đến quận An Bình và chuyển nơi đây thành Bảo tàng Tư Pháp, hoạt động từ thời điểm đó cho đến ngày nay. 

Được thiết kế bởi kiến ​​trúc sư Nhật Bản Takaharu Onogi, đây là một tổng thể kiến trúc vô cùng độc đáo với mái mansard, một kiểu mái phổ biến vào thế kỷ 19 và được người  Nhật Bản áp dụng rộng rãi trong các công trình xây dựng tại Đài Nam. Tuy nhiên, tòa nhà là nơi duy nhất tại Đài Nam vẫn còn bảo tồn kiểu mái mansard. 

Với tổng cộng hai lối vào, một cổng dành riêng cho các nhân viên bảo tàng, một cổng dành riêng cho khách tham quan. Để vào được bên trong khuôn viên bảo tàng, bạn sẽ đi qua một cái cổng lớn được thiết kế chạm khắc tinh xảo, tám cây cột lớn, tạo cho bạn cảm giác như bước vào một khu vực trang nghiêm. Bạn sẽ được tận mắt chứng kiến một kiến trúc phức tạp và nguy nga, nổi bật nhất là mái vòm Baroque bao gồm tám mặt với một tháp nhỏ trên đỉnh. Mái vòm được trang trí với tám cửa sổ nhỏ giúp tòa nhà đón được ánh sáng tự nhiên. Dự án chuyển đổi mục đích sử dụng tòa nhà từ tòa án dân sự sang bảo tàng tư pháp tôn vinh diện mạo và phong cách riêng biệt của tòa nhà và đóng góp tích cực cho công cuộc nghiên cứu và lưu trữ các tài liệu tư pháp trải qua các thời kỳ lịch sử quan trọng của Đài Loan. Dự án đã được công nhận là một ví dụ điển hình cho việc bảo tồn và phát huy lịch sử văn hóa Đài Loan và giành được Giải thưởng Bảo tồn Di sản Văn hóa Quốc gia năm 2017.

Ngày nay, Bảo tàng Tư pháp Đài Nam đã trở thành một địa danh văn hóa mới ở cố đô Đài Loan. Ngoài việc lưu giữ những ký ức và lịch sử phát triển của ngành tư pháp ở Đài Loan, nó còn phục vụ cho việc thúc đẩy giáo dục tư pháp và giúp công chúng tìm hiểu thêm về hệ thống tư pháp của đất nước này. 

Bảo tàng mở cửa phục vụ khách tham quan các ngày trong tuần trừ Thứ Hai từ 09.00 AM đến 05.00 PM, miễn phí vé tham quan. Bảo tàng năm ngay trung tâm thành phố Đài Nam, mất tầm vài phút đi bộ từ ga Đài Nam.